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Inserir constraints para garantir a não repetição de equivalências redundantes no banco. Por exemplo, quando as instâncias de EquivalenciaDisciplina são:

[
  {
    "id": 1,
    "disciplina1": 1,
    "disciplina2": 2
  },
  {
    "id": 2,
    "disciplina1": 1,
    "disciplina2": 3
  },
  {
    "id": 3,
    "disciplina1": 1,
    "disciplina2": 3
  },
  {
    "id": 4,
    "disciplina1": 1,
    "disciplina2": 3
  },
  {
    "id": 5,
    "disciplina1": 3,
    "disciplina2": 1
  },
  {
    "id": 6,
    "disciplina1": 3,
    "disciplina2": 1
  },
  {
    "id": 7,
    "disciplina1": 3,
    "disciplina2": 1
  }
]

A relação entre as disciplinas de id 1 e 3 aparecem diversas vezes, como (1,3) e (3,1), que representam a mesma coisa.

A princípio, este problema está sendo tratado na hora de retornar as equivalências, eliminado os IDs repetidos.