WIP: Create scripts to update db with valid data

The scripts export data from varian db to pinsis db keeping only truly executed treatment sessions. The table machineuse_upd is used as a temporary data holder and machineuse is appended with the new registries. Data from dbtest.machineuse should be anonimized before these scripts are ran.

@rgpa18

Rejeitado! Motivo:

Não redirecione nada para /dev/null ao menos que gere uma flag [--quiet|-q]. ainda não é necessário as flags, pois deve ser um script simples, apenas deixe ir stdout para tela.

copyCSV.sh

Separe os comando sql. coloque em array as tabelas e expanda no for.

exportCSV.sh

Separe o sql. coloque em um array as tabelas e expanda no for.

adjustDataBase.sh

veja que você dispara todos os scripts a partir deste, logo todas as váriaveis são dependentes. Faça checagem de todas as variáveis de database_info.sh; include host para a conexão do postgres.

filterMachineUse.sh

falta flag -h no comando psql, no caso da pinsisdev funciona, pq esta configurado como trust localhost, caso execute o script em outro ambiente não funcionará.

Apesar de estar funcional a sua lógica, não é muito legível.

Separe o comando sql em uma variável, assim ficará mais legível, e.g.: psql -h ${host} -U ${user_psql} -d

{db_psql} -c "

SUA_VAR"

não abuse do shell, quanto mais legível melhor, o c3 tem muita rotatividade de bolsistas.

updateMachineUse.sh

Separe sql.

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